Разницы никакой нет. Просто с автобусной остановки "Na Knížecí" автобус уходит каждый час (9.00, 10.00, 11.00) а с Florenc каждые два часа (9.30, 11.30). Все зависит от Вашего желания и т.д. Плюс как пройдете пограничников и таможню. Теоретически если вы прилетаете в 8, можете, пройдя все процедуры, сесть в автобус 191 (в 8.50) до конечной остановки "Na Knížecí" , там пройдя несколько минут оказаться сразу на вокзале и уехать на 10.00. Либо поехать чуть раньше на автобусе 119 (08.42) до остановки Nádraží Veleslavín, потом на метро до Florenc и там уже уехать в 9.30, но это впритык. На Florenc будете ориентировочно в 9.25. (пять минут на покупку билета и поиск нужного автобуса)